自17世纪起，少量穆斯林从印度尼西亚群岛来到荷兰。在荷兰本土，伊斯兰教直到20世纪下半叶才成为一场重要的运动。根据哥伦比亚广播公司（CBS）的劳动力调查，2015年约有4.9%的18岁及以上居民认为自己是穆斯林；而参考同一项研究的荷兰统计局（SCP）则认为，15岁及以上人群的穆斯林比例为6%，而年轻人群的比例可能更高。这使得伊斯兰教成为荷兰继基督教之后最大的宗教。20世纪60年代，第一批土耳其和摩洛哥客籍工人抵达荷兰，他们建立了自己的清真寺，并要求在伊斯兰节日休假。摩洛哥社区在阿姆斯特丹建造了荷兰第一座清真寺——卡比尔清真寺（Al Kabir Mosque）。随后，土耳其社区在阿尔梅洛建造了荷兰第三座清真寺——尤努斯·恩雷清真寺（Yunus Enre Mosque）。 1963 年，荷兰本土首次出现改宗荷兰原住民的报道，估计涉及 300 名荷兰人。据估计，2019 年改宗的荷兰原住民人数约为 21,000 人。20 世纪 60 年代，家庭团聚受到法律管制。2018 年，荷兰共有 52 所伊斯兰小学和 4 所中学（自 2001 年起的阿姆斯特丹伊斯兰学院和自 2000 年起的鹿特丹伊本·加尔敦伊斯兰学校等）。一项研究表明，至少需要一百所小学。自 20 世纪 90 年代中期以来，出现了两所（非政府认可的）伊斯兰大学，而 2005 年至少有四所非官方的伊斯兰高等教育机构。2020 年，荷兰共有 475 座清真寺。 2018年4月，土耳其圣索菲亚清真寺被阿姆斯特丹居民评选为阿姆斯特丹最美丽的建筑。

直到 2007 年，荷兰统计局 (CBS) 一直预计 2006 年荷兰的穆斯林数量将突破 100 万。据估计，2004 年底荷兰有 944,000 名穆斯林，其中 6,000 人是荷兰本地人。非本地穆斯林的数量是根据原籍国的穆斯林百分比估算出来的。在最近的基于 POLS 调查的估计中，荷兰统计局得出的结论是 2005 年的穆斯林数量为 877,000 人，2006 年为 837,000 人。2008 年，穆斯林数量进一步下降至约 825,000 人。这约占总人口的 5%。数字的波动可能与样本的可靠性裕度较大有关。预计直到 2022-2023 年，穆斯林人数才会达到 100 万。对 2050 年穆斯林数量的预估各不相同，取决于初始值和所采用的移民情景：2017 年，AtlasBridges 认为，如果难民危机持续发生，穆斯林数量可能增长高达 15%。这些研究的总体基调是，荷兰的伊斯兰教信徒数量正在增长。自 2015 年以来，摩洛哥穆斯林已成为荷兰穆斯林中最大的群体，约有 355,883 人，其次是土耳其穆斯林，有近 325,000 人。在“其他非西方移民”群体中，苏里南人是最大的群体，有 34,000 人，其次是阿富汗人，有 31,000 人，伊拉克人有 27,000 人。荷兰统计局在 2007 年估计本土伊斯兰教信徒的数量约为 12,000 人，但这个数字还包括第三代移民。